Der Club Nintendo rüstet sich für den neuen Nintendo eShop des Nintendo 3DS, der Ende Mai per Update erscheint. So müssen alle Mitglieder bis zum 31. Mai 2011 den neuen Datenschutzrichtlinien zustimmen, ansonsten wird ihr Club Nintendo-Konto und ihre -Mitgliedschaft deaktiviert.
Aufgrund der Neuerungen kann man davon ausgehen, dass es auch im neuen Download-Store möglich ist, eine Verbindung zu seinem Club Nintendo-Konto herzustellen, etwa um „Sterne“ zu verdienen. Diese kann man dann kostenlos gegen Prämien, wie Merchandising-Artikel und Spielehilfen einzutauschen.